妊娠期用藥有可能影響胎兒的正常發育，這一點目前已引起人們的高度重視，但也不可談藥色變，得了病硬扛著不治，尤其是感染性疾病，這樣對孕婦及胎兒都不利。其實妊娠期只要正確選用抗生素，是能做到既能治療孕婦疾病又不影響胎兒健康的。
目前已有足夠的證據證明，青霉素類(如青霉素、氨芐西林、阿莫西林、氧哌嗪青霉素、美洛西林等)及頭孢菌素類(如頭孢氨芐、頭孢唑啉、頭孢拉定等)抗生素對胎兒是安全的。以上兩類藥物都能抑制細菌細胞壁合成而起到殺菌作用，人的細胞沒有細胞壁，故藥物的毒性低，可安全用于妊娠各期感染患者。大環內酯類(如紅霉素、白霉素、林可霉素、嚴迪、羅紅霉素等)毒性也小，也可用于孕婦。
氨基甙類抗生素(如慶大霉素、卡那霉素、丁胺卡那霉素、妥布霉素等)對胎兒聽力及腎臟有損害。四環素類抗生素(如四環素、土霉素、強力霉素、甲烯土霉素等)容易經胎盤進入胎兒體內，孕早期可致胎兒畸形，四肢發育不良及小肢畸形，孕中期可致牙蕾發育不良，從而使乳牙呈棕黃色及牙釉質發育不良，恒牙發育也受影響，易造成齲齒，孕后期可引起肝、腎損害。喹諾酮類(如吡哌酸、氟哌酸、氟啶酸、氟嗪酸等)在動物實驗中可引起幼崽兒關節發育受損，雖然在人尚無這方面的證據，應用時也應謹慎?；前奉?磺胺甲基異惡唑等)，容易通過胎盤進入胎兒體內，與血漿蛋白結合，而將膽紅素替換出來導致新生兒黃疸。甲硝唑類藥物容易通過胎盤進入胎兒體內，動物實驗有致畸作用，尤其是妊娠頭3個月，組織器官形成時期更是危險，故不宜應用。
總之，妊娠期患了感染性疾病既不可以硬扛著不治，也不可盲目濫用藥物，要及時到醫院在醫生指導下合理選用藥物進行治療。
